适用于母牛妊娠诊断的一种最方便、最可行的方法。此法在妊娠的各个阶段均可采用，能判断母牛是否怀孕、怀孕的大体月份、一些生殖器官疾病及胎儿的存活情况。有经验人员可在配种后40～60天判断妊娠与否，准确率达90%以上。
直肠检查判定母牛是否怀孕的主要依据是怀孕后生殖器官的一些变化。这些变化因胎龄的不同而表现有所侧重，在怀孕初期，以子宫角形状、质地及卵巢的变化为主；在胎胞形成后，则以胎胞的发育为主；当胎胞下沉、不易触摸时，以卵巢位置及子宫动脉的妊娠脉搏为主。
(1)配种后19～22天：子宫勃起反应不明显，在上次发情时卵巢上的排卵处有发育成熟的黄体，黄体柔软，孕侧卵巢较对侧卵巢大，疑为妊娠。如果子宫勃起反应明显，无明显的黄体，卵巢上有大于1厘米的卵泡，或卵巢局部有凹陷、质地较软，可能是刚排过卵，这两种情况均表现未孕。
(2)妊娠30天：孕侧卵巢有发育完善的妊娠黄体，黄体肩端丰满，顶端突起，卵巢体积较对侧卵巢大1倍；两侧子宫角不对称，孕角较空角稍增大，质地变软，有液体波动的感觉，孕角最膨大处子宫壁较薄，空角较硬而有弹性，弯曲明显，角间沟清楚，用手指轻握孕角从一端向另一端轻轻滑动，可感到胎膜囊由指间滑动，如用拇指及食指轻轻提起子宫角，然后稍为放松，可以感到子宫壁内先有一层薄膜滑开，这就是尚未附植的胚囊。据测定，妊娠28天，羊膜囊直径2厘米，35天为3厘米，40天以前羊膜囊为球形，这时的直肠检查一定要小心，动作要轻柔，并避免长时间触摸，以免引起流产。
(3)妊娠60天：由于胎水增加，孕角增大且向背侧突出。孕角比空角约粗一倍，且较长，两者悬殊明显。孕角内有波动感，用手指按压有弹性。角间沟不甚清楚，但仍能分辨，可以摸到全部子宫。
(4)妊娠90天：孕角如排球大小，波动明显，有时可触及漂浮在子宫腔内如硬块的胎儿，角间沟已摸不清楚。这时子宫开始深入腹腔，子宫颈移至耻骨前缘，初产牛子宫下沉时间较晚。
(5)妊娠120天：子宫全部沉入腹腔，子宫颈越过耻骨前缘，触摸不清子宫轮廓的形状，只能触摸到子宫背侧面及该处明显突出的子叶，形如蚕豆或黄豆，偶尔能摸到胎儿。子宫动脉的妊娠脉搏明显可感。
(6)妊娠150天：全部子宫沉人腹腔底部，由于胎儿迅速发育增大，能够清楚地触及胎儿。子叶逐渐增大，如胡桃或鸡蛋；子宫动脉变粗，妊娠脉搏十分明显，空角侧子宫动脉尚无或稍有妊娠脉搏。
(7)妊娠180天至分娩：胎儿增大，位置移至骨盆前，能触摸到胎儿的各部分，并能感到胎动，两侧子宫动脉均有明显的妊娠脉搏。
